Для школьников, демонстрирующих успехи в науках, в Центре организованы образовательные программы по математике, информатике, физике, химии, биологии и филологии.
Предусмотрено три вида образовательных программ: профильные интенсивные смены (7 дней заочный модуль,
7 дней очный модуль с круглосуточным пребыванием на территории Центра), программы с применением дистанционных технологий (программы включают лекции и практические занятия в онлайн формате), программы дополнительного образования (предполагают регулярные встречи руководителей программ и учащихся). Руководителями программ выступают самые яркие и опытные педагоги.